Breast cancer risk variants at 6q25 display different phenotype associations and regulate ESR1, RMND1 and CCDC170 Journal Article


Authors: Dunning, A. M.; Michailidou, K.; Kuchenbaecker, K. B.; Thompson, D.; French, J. D.; Beesley, J.; Healey, C. S.; Kar, S.; Pooley, K. A.; Lopez-Knowles, E.; Dicks, E.; Barrowdale, D.; Sinnott-Armstrong, N. A.; Sallari, R. C.; Hillman, K. M.; Kaufmann, S.; Sivakumaran, H.; Marjaneh, M. M.; Lee, J. S.; Hills, M.; Jarosz, M.; Drury, S.; Canisius, S.; Kbolla, M.; Dennis, J.; Wang, Q.; Lhopper, J.; Southey, M. C.; Broeks, A.; Schmidt, M. K.; Lophatananon, A.; Muir, K.; Beckmann, M. W.; Fasching, P. A.; Dos-Santos-Silva, I.; Peto, J.; Sawyer, E. J.; Tomlinson, I.; Burwinkel, B.; Marme, F.; Guénel, P.; Truong, T.; Bojesen, S. E.; Flyger, H.; Gonzlez-Neira, A.; Perez, J. I. A.; Anton-Culver, H.; Eunjung, L.; Arndt, V.; Brenner, H.; Meindl, A.; Schmutzler, R. K.; Brauch, H.; Hamann, U.; Aittomki, K.; Blomqvist, C.; Ito, H.; Matsuo, K.; Bogdanova, N.; Dörk, T.; Lindblom, A.; Margolin, S.; Kosma, V. M.; Mannermaa, A.; Tseng, C. C.; Wu, A. H.; Lambrechts, D.; Wildiers, H.; Chang-Claude, J.; Rudolph, A.; Peterlongo, P.; Radice, P.; Eolson, J.; Ggiles, G.; Milne, R. L.; Haiman, C. A.; Henderson, B. E.; Goldberg, M. S.; Teo, S. H.; Yip, C. H.; Nord, S.; Borresen-Dale, A. L.; Kristensen, V.; Long, J.; Zheng, W.; Pylks, K.; Winqvist, R.; Andrulis, I. L.; Knight, J. A.; Devilee, P.; Seynaeve, C.; Figueroa, J.; Sherman, M. E.; Czene, K.; Darabi, H.; Hollestelle, A.; Van Den Ouweland, A. M. W.; Humphreys, K.; Gao, Y. T.; Shu, X. O.; Cox, A.; Cross, S. S.; Blot, W.; Cai, Q.; Ghoussaini, M.; Perkins, B. J.; Shah, M.; Choi, J. Y.; Kang, D.; Lee, S. C.; Hartman, M.; Kabisch, M.; Torres, D.; Jakubowska, A.; Lubinski, J.; Brennan, P.; Sangrajrang, S.; Ambrosone, C. B.; Toland, A. E.; Shen, C. Y.; Wu, P. E.; Orr, N.; Swerdlow, A.; McGuffog, L.; Healey, S.; Lee, A.; Kapuscinski, M.; John, E. M.; Terry, M. B.; Daly, M. B.; Goldgar, D. E.; Buys, S. S.; Janavicius, R.; Tihomirova, L.; Tung, N.; Dorfling, C. M.; Van Rensburg, E. J.; Neuhausen, S. L.; Ejlertsen, B.; Ohansen, T. V.; Osorio, A.; Benitez, J.; Rando, R.; Weitzel, J. N.; Bonanni, B.; Peissel, B.; Manoukian, S.; Papi, L.; Ottini, L.; Konstantopoulou, I.; Apostolou, P.; Garber, J.; Rashid, M. U.; Frost, D.; EMBRACE; Izatt, L.; Ellis, S.; Godwin, A. K.; Arnold, N.; Niederacher, D.; Rhiem, K.; Bogdanova-Markov, N.; Sagne, C.; Stoppa-Lyonnet, D.; Damiola, F.; GEMO Study Collaborators; Sinilnikova, O. M.; Mazoyer, S.; Isaacs, C.; McLaes, K. B.; De Leeneer, K.; De La Hoya, M.; Caldes, T.; Nevanlinna, H.; Khan, S.; Mensenkamp, A. R.; HEBON; Hooning, M. J.; Rookus, M. A.; Kwong, A.; Olah, E.; Diez, O.; Brunet, J.; Pujana, M. A.; Gronwald, J.; Huzarski, T.; Barkardottir, R. B.; Laframboise, R.; Soucy, P.; Montagna, M.; Agata, S.; Teixeira, M. R.; kConFab Investigators; Park, S. K.; Lindor, N.; Couch, F. J.; Tischkowitz, M.; Foretova, L.; Vijai, J.; Offit, K.; Singer, C. F.; Rappaport, C.; Mphelan, C.; Greene, M. H.; Mai, P. L.; Rennert, G.; Imyanitov, E. N.; Hulick, P. J.; Phillips, K. A.; Piedmonte, M.; Mulligan, A. M.; Glendon, G.; Bojesen, A.; Thomassen, M.; Caligo, M. A.; Yoon, S. Y.; Friedman, E.; Laitman, Y.; Borg, A.; Von Wachenfeldt, A.; Ehrencrona, H.; Rantala, J.; Olopade, O. I.; Ganz, P. A.; Nussbaum, R. L.; Gayther, S. A.; Lnathanson, K.; Domchek, S. M.; Arun, B. K.; Mitchell, G.; Karlan, B. Y.; Lester, J.; Maskarinec, G.; Woolcott, C.; Scott, C.; Stone, J.; Apicella, C.; Tamimi, R.; Luben, R.; Khaw, K. T.; Helland, S.; Haakensen, V.; Dowsett, M.; Pharoah, P. D. P.; Simard, J.; Hall, P.; Garca-Closas, M.; Vachon, C.; Chenevix-Trench, G.; Antoniou, A. C.; Easton, D. F.; Edwards, S. L.
Article Title: Breast cancer risk variants at 6q25 display different phenotype associations and regulate ESR1, RMND1 and CCDC170
Abstract: We analyzed 3,872 common genetic variants across the ESR1 locus (encoding estrogen receptor α) in 118,816 subjects from three international consortia. We found evidence for at least five independent causal variants, each associated with different phenotype sets, including estrogen receptor (ER + or ER -) and human ERBB2 (HER2 + or HER2 -) tumor subtypes, mammographic density and tumor grade. The best candidate causal variants for ER - tumors lie in four separate enhancer elements, and their risk alleles reduce expression of ESR1, RMND1 and CCDC170, whereas the risk alleles of the strongest candidates for the remaining independent causal variant disrupt a silencer element and putatively increase ESR1 and RMND1 expression. © 2016 Nature America, Inc.
Journal Title: Nature Genetics
Volume: 48
Issue: 4
ISSN: 1061-4036
Publisher: Nature Publishing Group  
Date Published: 2016-04-01
Start Page: 374
End Page: 386
Language: English
DOI: 10.1038/ng.3521
PROVIDER: scopus
PUBMED: 26928228
PMCID: PMC4938803
DOI/URL:
Notes: Article -- Export Date: 2 May 2016 -- Source: Scopus
Altmetric
Citation Impact
BMJ Impact Analytics
MSK Authors
  1. Kenneth Offit
    789 Offit
  2. Vijai Joseph
    211 Joseph