Identification of 12 new susceptibility loci for different histotypes of epithelial ovarian cancer Journal Article


Authors: Phelan, C. M.; Kuchenbaecker, K. B.; Tyrer, J. P.; Kar, S. P.; Lawrenson, K.; Winham, S. J.; Dennis, J.; Pirie, A.; Riggan, M. J.; Chornokur, G.; Earp, M. A.; Lyra, P. C.; Lee, J. M.; Coetzee, S.; Beesley, J.; McGuffog, L.; Soucy, P.; Dicks, E.; Lee, A.; Barrowdale, D.; Lecarpentier, J.; Leslie, G.; Aalfs, C. M.; Aben, K. K. H.; Adams, M.; Adlard, J.; Andrulis, I. L.; Anton-Culver, H.; Antonenkova, N.; AOCS study group; Aravantinos, G.; Arnold, N.; Arun, B. K.; Arver, B.; Azzollini, J.; Balmana, J.; Banerjee, S. N.; Barjhoux, L.; Barkardottir, R. B.; Bean, Y.; Beckmann, M. W.; Beeghly-Fadiel, A.; Benitez, J.; Bermisheva, M.; Bernardini, M. Q.; Birrer, M. J.; Bjorge, L.; Black, A.; Blankstein, K.; Blok, M. J.; Bodelon, C.; Bogdanova, N.; Bojesen, A.; Bonanni, B.; Borg, A.; Bradbury, A. R.; Brenton, J. D.; Brewer, C.; Brinton, L.; Broberg, P.; Brooks-Wilson, A.; Bruinsma, F.; Brunet, J.; Buecher, B.; Butzow, R.; Buys, S. S.; Caldes, T.; Caligo, M. A.; Campbell, I.; Cannioto, R.; Carney, M. E.; Cescon, T.; Chan, S. B.; Chang-Claude, J.; Chanock, S.; Chen, X. Q.; Chiew, Y. E.; Chiquette, J.; Chung, W. K.; Claes, K. B. M.; Conner, T.; Cook, L. S.; Cook, J.; Cramer, D. W.; Cunningham, J. M.; D'Aloisio, A. A.; Daly, M. B.; Damiola, F.; Damirovna, S. D.; Dansonka-Mieszkowska, A.; Dao, F.; Davidson, R.; DeFazio, A.; Delnatte, C.; Doheny, K. F.; Diez, O.; Ding, Y. C.; Doherty, J. A.; Domchek, S. M.; Dorfling, C. M.; Dork, T.; Dossus, L.; Duran, M.; Durst, M.; Dworniczak, B.; Eccles, D.; Edwards, T.; Eeles, R.; Eilber, U.; Ejlertsen, B.; Ekici, A. B.; Ellis, S.; Elvira, M.; EMBRACE Study; Eng, K. H.; Engel, C.; Evans, D. G.; Fasching, P. A.; Ferguson, S.; Ferrer, S. F.; Flanagan, J. M.; Fogarty, Z. C.; Fortner, R. T.; Fostira, F.; Foulkes, W. D.; Fountzilas, G.; Fridley, B. L.; Friebel, T. M.; Friedman, E.; Frost, D.; Ganz, P. A.; Garber, J.; Garcia, M. J.; Garcia-Barberan, V.; Gehrig, A.; GEMO Study Collaborators; Gentry-Maharaj, A.; Gerdes, A. M.; Giles, G. G.; Glasspool, R.; Glendon, G.; Godwin, A. K.; Goldgar, D. E.; Goranova, T.; Gore, M.; Greene, M. H.; Gronwald, J.; Gruber, S.; Hahnen, E.; Haiman, C. A.; Hakansson, N.; Hamann, U.; Hansen, T. V. O.; Harrington, P. A.; Harris, H. R.; Hauke, J.; HEBON Study; Hein, A.; Henderson, A.; Hildebrandt, M. A. T.; Hillemanns, P.; Hodgson, S.; Hogdall, C. K.; Hogdall, E.; Hogervorst, F. B. L.; Holland, H.; Hooning, M. J.; Hosking, K.; Huang, R. Y.; Hulick, P. J.; Hung, J.; Hunter, D. J.; Huntsman, D. G.; Huzarski, T.; Imyanitov, E. N.; Isaacs, C.; Iversen, E. S.; Izatt, L.; Izquierdo, A.; Jakubowska, A.; James, P.; Janavicius, R.; Jernetz, M.; Jensen, A.; Jensen, U. B.; John, E. M.; Johnatty, S.; Jones, M. E.; Kannisto, P.; Karlan, B. Y.; Karnezis, A.; Kast, K.; KCon Fab Investigators; Kennedy, C. J.; Khusnutdinova, E.; Kiemeney, L. A.; Kiiski, J. I.; Kim, S. W.; Kjaer, S. K.; Kobel, M.; Kopperud, R. K.; Kruse, T. A.; Kupryjanczyk, J.; Kwong, A.; Laitman, Y.; Lambrechts, D.; Larranaga, N.; Larson, M. C.; Lazaro, C.; Le, N. D.; Le Marchand, L.; Lee, J. W.; Lele, S. B.; Leminen, A.; Leroux, D.; Lester, J.; Lesueur, F.; Levine, D. A.; Liang, D.; Liebrich, C.; Lilyquist, J.; Lipworth, L.; Lissowska, J.; Lu, K. H.; Lubinski, J.; Luccarini, C.; Lundvall, L.; Mai, P. L.; Mendoza-Fandino, G.; Manoukian, S.; Massuger, Lfag; May, T.; Mazoyer, S.; McAlpine, J. N.; McGuire, V.; McLaughlin, J. R.; McNeish, I.; Meijers-Heijboer, H.; Meindl, A.; Menon, U.; Mensenkamp, A. R.; Merritt, M. A.; Milne, R. L.; Mitchell, G.; Modugno, F.; Moes-Sosnowska, J.; Moffitt, M.; Montagna, M.; Moysich, K. B.; Mulligan, A. M.; Musinsky, J.; Nathanson, K. L.; Nedergaard, L.; Ness, R. B.; Neuhausen, S. L.; Nevanlinna, H.; Niederacher, D.; Nussbaum, R. L.; Odunsi, K.; Olah, E.; Olopade, O. I.; Olsson, H.; Olswold, C.; O'Malley, D. M.; Ong, K. R.; Onland-Moret, N. C.; OPAL study group; Orr, N.; Orsulic, S.; Osorio, A.; Palli, D.; Papi, L.; Park-Simon, T. W.; Paul, J.; Pearce, C. L.; Pedersen, I. S.; Peeters, P. H. M.; Peissel, B.; Peixoto, A.; Pejovic, T.; Pelttari, L. M.; Permuth, J. B.; Peterlongo, P.; Pezzani, L.; Pfeiler, G.; Phillips, K. A.; Piedmonte, M.; Pike, M. C.; Piskorz, A. M.; Poblete, S. R.; Pocza, T.; Poole, E. M.; Poppe, B.; Porteous, M. E.; Prieur, F.; Prokofyeva, D.; Pugh, E.; Pujana, M. A.; Pujol, P.; Radice, P.; Rantala, J.; Rappaport-Fuerhauser, C.; Rennert, G.; Rhiem, K.; Rice, P.; Richardson, A.; Robson, M.; Rodriguez, G. C.; Rodriguez-Antona, C.; Romm, J.; Rookus, M. A.; Rossing, M. A.; Rothstein, J. H.; Rudolph, A.; Runnebaum, I. B.; Salvesen, H. B.; Sandler, D. P.; Schoemaker, M. J.; Senter, L.; Setiawan, V. W.; Severi, G.; Sharma, P.; Shelford, T.; Siddiqui, N.; Side, L. E.; Sieh, W.; Singer, C. F.; Sobol, H.; Song, H. L.; Southey, M. C.; Spurdle, A. B.; Stadler, Z.; Steinemann, D.; Stoppa-Lyonnet, D.; Sucheston-Campbell, L. E.; Sukiennicki, G.; Sutphen, R.; Sutter, C.; Swerdlow, A. J.; Szabo, C. I.; Szafron, L.; Tan, Y. Y.; Taylor, J. A.; Tea, M. K.; Teixeira, M. R.; Teo, S. H.; Terry, K. L.; Thompson, P. J.; Thomsen, L. C. V.; Thull, D. L.; Tihomirova, L.; Tinker, A. V.; Tischkowitz, M.; Tognazzo, S.; Toland, A. E.; Tone, A.; Trabert, B.; Travis, R. C.; Trichopoulou, A.; Tung, N.; Tworoger, S. S.; Van Altena, A. M.; Van den Berg, D.; van der Hout, A. H.; van der Luijt, R. B.; Van Heetvelde, M.; Van Nieuwenhuysen, E.; Van Rensburg, E. J.; Vanderstichele, A.; Varon-Mateeva, R.; Vega, A.; Edwards, D. V.; Vergote, I.; Vierkant, R. A.; Vijai, J.; Vratimos, A.; Walker, L.; Walsh, C.; Wand, D.; Wang-Gohrke, S.; Wappenschmidt, B.; Webb, P. M.; Weinberg, C. R.; Weitzel, J. N.; Wentzensen, N.; Whittemore, A. S.; Wijnen, J. T.; Wilkens, L. R.; Wolk, A.; Woo, M.; Wu, X.; Wu, A. H.; Yang, H.; Yannoukakos, D.; Ziogas, A.; Zorn, K. K.; Narod, S. A.; Easton, D. F.; Amos, C. I.; Schildkraut, J. M.; Ramus, S. J.; Ottini, L.; Goodman, M. T.; Park, S. K.; Kelemen, L. E.; Risch, H. A.; Thomassen, M.; Offit, K.; Simard, J.; Schmutzler, R. K.; Hazelett, D.; Monteiro, A. N.; Couch, F. J.; Berchuck, A.; Chenevix-Trench, G.; Goode, E. L.; Sellers, T. A.; Gayther, S. A.; Antoniou, A. C.; Pharoah, P. D. P.
Article Title: Identification of 12 new susceptibility loci for different histotypes of epithelial ovarian cancer
Abstract: To identify common alleles associated with different histotypes of epithelial ovarian cancer (EOC), we pooled data from multiple genome-wide genotyping projects totaling 25,509 EOC cases and 40,941 controls. We identified nine new susceptibility loci for different EOC histotypes: six for serous EOC histotypes (3q28, 4q32.3, 8q21.11, 10q24.33, 18q11.2 and 22q12.1), two for mucinous EOC (3q22.3 and 9q31.1) and one for endometrioid EOC (5q12.3). We then performed meta-analysis on the results for high-grade serous ovarian cancer with the results from analysis of 31,448 BRCA1 and BRCA2 mutation carriers, including 3,887 mutation carriers with EOC. This identified three additional susceptibility loci at 2q13, 8q24.1 and 12q24.31. Integrated analyses of genes and regulatory biofeatures at each locus predicted candidate susceptibility genes, including OBFC1, a new candidate susceptibility gene for low-grade and borderline serous EOC.
Keywords: risk; population; endometriosis; mutations; breast-cancer; association; metaanalysis; clear-cell carcinoma; common variants; telomere length
Journal Title: Nature Genetics
Volume: 49
Issue: 5
ISSN: 1061-4036
Publisher: Nature Publishing Group  
Date Published: 2017-05-01
Start Page: 680
End Page: 691
Language: English
ACCESSION: WOS:000400051400008
DOI: 10.1038/ng.3826
PROVIDER: wos
PUBMED: 28346442
PMCID: PMC5612337
Notes: Article -- Source: Wos
Altmetric Score
MSK Authors
  1. Malcolm Pike
    132 Pike
  2. Kenneth Offit
    509 Offit
  3. Mark E Robson
    365 Robson
  4. Douglas A Levine
    356 Levine
  5. Vijai Joseph
    117 Joseph
  6. Fanny Dao
    56 Dao